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南京信帆生物:組織印跡的Northern雜交
更新時(shí)間:2016-04-20   點(diǎn)擊次數(shù):1334次

1)硝酸纖維素膜或尼龍膜上的組織印跡 

1.在塑料板上放置兩層Whatman 1號(hào)濾紙,在濾紙上方放上一張普通紙,然后鋪上一層尼龍膜。 

2.用雙面刀片從植物組織如大豆的莖上切取一塊切片(厚度約為1mm)。如果組織表面是濕的,則在Kimwipes紙上輕輕吸干或先用蒸餾水洗滌幾秒鐘然后再用Kimwipes紙吸干。用鑷子將組織切片轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,注意一旦將切片放置在膜上就不得再移動(dòng)切片。在切片上放置4層Kimwipes紙,用手指輕壓15~20秒,用鑷子小心拿開紙和組織切片。組織切片經(jīng)甲苯酸藍(lán)染色后觀察其解剖結(jié)果。 

3.80℃真空烘烤留有組織印跡的尼龍膜2小時(shí)或用UV cross-linker在紫外光下照射尼龍膜。 

4.將留有印跡的膜面向下,放入載玻片上的一滴甲苯酸藍(lán)溶液中,對(duì)組織切片進(jìn)行染色。2~3分鐘后,吸干多余的染料,用間接照明立刻照相。將載玻片翻轉(zhuǎn),透過玻璃拍攝被染色的組織切片。在切片上粘上幾張紙片以免組織切片接觸顯微鏡。 

2)用35S-標(biāo)記的RNA探針檢測(cè)植物印跡中的mRNA 

1.在Seal-A-MealTM塑料帶中倒入30~40ml洗滌溶液I,65℃清洗留有印跡的尼龍膜4小時(shí)。 

2.將膜放入20ml雜交溶液中,68℃預(yù)雜交4小時(shí)。 

3.將膜和用35S-標(biāo)記的RNA放入10ml雜交溶液中,68℃雜交20小時(shí)。 

4.在 100ml洗滌溶液Ⅱ中42℃清洗尼龍膜20分鐘,換上新鮮洗滌溶液,重復(fù)清洗2次。 

5.用100ml洗滌溶液Ⅲ在適當(dāng)?shù)臏囟认拢?0~68℃)。用手提式微型檢測(cè)器監(jiān)控尼龍膜上剩余的放射性。清洗完畢后,有義RNA探針雜交的膜不再有放射性信號(hào),但用反義RNA探針雜交的尼龍膜一般具有可檢測(cè)的放射性信號(hào)。該信號(hào)的強(qiáng)度依賴于目的RNA的豐度。室溫下用0.2×SSC對(duì)尼龍膜進(jìn)行簡(jiǎn)單清洗,在空氣中晾干。 

洗滌緩沖液Ⅲ: 

0.1 mol/L Tris-HCl(pH8.0) 

1 mmol/L EDTA 

6.將膜暴露在X-射線膠卷或Kodak T-max 400膠卷下進(jìn)行放射自顯影。用水平力如一小疊書使膜和膠卷保持良好的接觸。一般來說,利用T-max 400膠卷比X-射線膠卷具有更高的分辨率。放射自顯影的時(shí)間依賴于放射性信號(hào)的強(qiáng)弱,通常從4小時(shí)到4天。 

7.在X-射線處理器中對(duì)X-射線膠卷顯影。把T-max400膠卷浸入Kodak T-max顯影液I中顯影1分鐘,將底片轉(zhuǎn)移到顯影終止盤中30秒后浸入Kodak快速定影液中5分鐘,然后用蒸餾水洗滌5分鐘。 

8.在解剖顯微鏡下觀察組織印跡中mRNA的位置。用Kodak Technical Pan Film 2415膠卷拍攝mRNA的定位模式,然后和用苯甲酸藍(lán)染色的組織切片解剖結(jié)果比較。 

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